Waarom je NIET altijd moet filteren op free full text in PubMed

In PubMed bestaat de mogelijkheid om je zoekresultaten te filteren op Abstract, Free full text en Full text. Maar wat gebeurt er precies achter de PubMed-schermen als je een van deze opties aanvinkt?

Abstract : je filtert je zoekresultaten op artikelen die een abstract hebben.
Dit levert iets minder artikelen op, maar heeft niet zoveel gevolgen, omdat PubMed de meeste artikelen van een samenvatting voorziet

Free full text: Je filtert je zoekresultaten op artikelen waarvan de volledige tekst (full text) vrij (free) beschikbaar is op internet. Je verwijdert op deze manier de artikelen waarvoor je een licentie nodig hebt (betaalde content). Je verwijdert dus artikelen waar je als student of docent misschien wel bij kunt!

Full Text: Je filtert je zoekresultaten op artikelen waarvan de volledige tekst (full text) beschikbaar is: óf omdat de artikelen vrij beschikbaar zijn op internet óf omdat de hogeschool een licentie op deze content heeft. 

Voorbeeld: als je NIET filtert op Free full text vind je een aantal waardevolle artikelen, zoals artikel 2 

Maar als je WEL filtert op Free full text vind je veel minder artikelen en is bijvoorbeeld artikel 2 verdwenen uit je resultatenlijst:

N.B. Via xplora@avans.nl kun je bijna alle artikelen aanvragen uit een andere bibliotheek voor 2,50 euro per artikel. Dat is minder dan een goede kop koffie :-)


Zie ook: Hoe vind je de volledige tekst (full text) van een artikel?

Oplossing voor problemen met fulltext vanuit PubMed

Door veranderingen in PubMed kan het tijdelijk lastig zijn om de  Full Text van een artikel te openen in PubMed op de gebruikelijke manier (klikken op het icoontje bij Full Text links)

We zijn bezig dit probleem op te lossen, maar zijn afhankelijk van PubMed

Hoe vind je de full text in de tussentijd?
Stap 1     Ga rechtstreeks naar de databank (Wiley, SpringerLink, Science Direct/Elsevier, Sage) via
               onze Xplora-site: https://xplora.avans.nl/introductie/databanken-a-z/index
Stap 2    Plak de titel van je artikel in het zoekvenster van de databank
Stap 3    Klik op de titel en daarna op PDF of HTML

MeSH of trefwoord: de versiering in de kerstboom

Een kerstboom in oktober? Jazeker! Om uit te leggen wat een MeSH term (of trefwoord) is!

Een wetenschappelijk artikel is de boom. 

PubMed, of een andere databank, neemt deze boom op in zijn verzameling en hangt er versiering in: de trefwoorden of MeSH termen.
De gele bal voor trefwoord X, de rode bal voor trefwoord Y, en een blauwe bal voor trefwoord Z, enzovoort. En een piek in de top om aan te geven om welk publicatietype het gaat. 

Wanneer jij vervolgens in Pubmed zoekt op trefwoord X, zoek je naar alle bomen waar die blauwe bal in hangt.

Doordat de stroom aan nieuwe bomen zo groot is, loopt PubMed achter met het versieren van alle bomen. De allernieuwste bomen vind je dus niet via de kerstballen, hiervoor gebruik je de woorden uit de titel of de samenvatting. 

Zie ook: instructievideo's over zoeken met MeSH en tiab
Zie ook: Waar zijn de PubMed Tutorials gebleven?

APA cursus

Binnen Avans is APA de meest gebruikte referentiestijl voor het correct vermelden van bronnen.

Naast de online gids met APA-richtlijnen op onze website, is er sinds kort ook
een online APA cursus beschikbaar!

De cursus bestaat uit drie delen:

• Leren werken met de APA-richtlijnen
• Specifiek zoeken naar APA-richtlijnen
• Test je APA-kennis

We zijn benieuwd naar je ervaringen! Laat het ons weten via xplora@avans.nl 

Waar zijn de PubMed tutorials gebleven?

Misschien is je ook al opgevallen dat PubMed vernieuwd is. Het heeft een nieuwe layout en de zoekresultaten kunnen er iets anders uitzien dan je gewend was. In een vorig blogbericht stond ik daar al uitgebreid bij stil.

In de nieuwe PubMed layout is nog geen link opgenomen naar de PubMed Tutorials, deze vind je met een beetje googlen op deze pagina: https://learn.nlm.nih.gov/documentation/training-packets/T0042010P/

DSM-5 online beschikbaar voor Avans

We hebben een nieuwe bron in onze Xplora-collectie opgenomen: DSM-5 online. Alle studenten en medewerkers van Avans hebben onbeperkt toegang.
Je vindt de DSM-5 online via de Xplora-website > databanken > Boom Portaal > Direct naar > DSM-5 online
OF via Xplora-website > Kaluga

De Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders (DSM) is een classificatiesysteem waarin internationale afspraken zijn gemaakt over welke criteria van toepassing zijn op een bepaalde psychische stoornis op basis van (nieuwe) wetenschappelijke inzichten. Meer informatie vind je op de website van de NVVP

Gebruik de algemene zoekfunctie of zoek via de optie 'Domeinen':

en Hulpmiddelen:

Bekijk dit filmpje met uitleg

Vragen? Stuur een mailtje naar xplora@avans.nl

PubMed is vernieuwd - Wat is er veranderd?

PubMed is m.i.v. 18 mei vernieuwd.
1. De belangrijkste veranderingen zijn cosmetisch van aard, waarbij PubMed een moderne lay-out heeft gekregen en beter toegankelijk is op mobiele devices.
2. Zoekstrategieën uit de oude PubMed werken ook in de nieuwe versie van PubMed, maar leveren soms iets andere resultaten op.

Verandering 1: PubMed lay-out

A Best match: resultaten worden nu standaard als Best match gepresenteerd (op basis van relevantie) en niet meer chronologisch (met nieuwste eerst). Dit kun je aanpassen bij elke zoekactie.
B Results by year: het aantal artikelen per jaar is zichtbaar gemaakt met een grafiek
C Abstract: stukjes van de samenvatting zijn al zichtbaar op de resultaat-pagina
D Article type: je kunt direct filteren op soort onderzoek. Bijv. ‘best evidence’ (rct’s, systematic reviews)
E Mesh dropdown menu: het dropdown menu met daarin o.a. MeSH is verwijderd. Wil je zoeken op trefwoorden (MeSH) dan gebruik je deze link: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/ óf de knop ‘MeSH Database’ op het beginscherm

Meer layout: makkelijke knip-plak opties:

Verandering 2: Standaard zoekacties leveren soms andere resultaten op

Zoekstrategieën uit de oude PubMed werken ook in de nieuwe versie van PubMed, maar leveren soms iets andere resultaten op vanwege een paar wijzigingen in het zoeken:

1) Automatische Term Mapping (ATM)
De syntax van de zoekstring en de Automatische Term Mapping (ATM) is uitgebreid. Vanaf nu houdt PubMed ook rekening met:
- Britse en Amerikaanse spelling
- enkelvoudsvorm en meervoudsvorm
- andere synoniemen van de zoekterm

Bijvoorbeeld: zoeken op Color levert in de nieuwe PubMed meer resultaten op dan in de oude, omdat er op meer synoniemen gezocht wordt:

Oude Pubmed: "colour"[All Fields] OR "color"[MeSH Terms] OR "color"[All Fields]

Nieuwe PubMed: "colorant"[All Fields] OR "colorants"[All Fields] OR "coloration"[All Fields] OR "colorations"[All Fields] OR "colored"[All Fields] OR "coloreds"[All Fields] OR "colorful"[All Fields] OR "colorfulness"[All Fields] OR "coloring"[All Fields] OR "colorings"[All Fields] OR "colorization"[All Fields] OR "colorized"[All Fields] OR "colour"[All Fields] OR "color"[MeSH Terms] OR "color"[All Fields] OR "colourant"[All Fields] OR "colourants"[All Fields] OR "colouration"[All Fields] OR "colourations"[All Fields] OR "coloured"[All Fields] OR "coloureds"[All Fields] OR "colourful"[All Fields] OR "colourfulness"[All Fields] OR "colouring"[All Fields] OR "colourings"[All Fields] OR "colours"[All Fields] OR "colors"[All Fields]

2) Trunceren
Het gebruik van een truncatie-teken * (waarmee je kunt zoeken op een deel van een woord), zorgt niet meer automatisch voor een frase-zoekactie.

Bijvoorbeeld: zoeken op breast feed* levert in de nieuwe PubMed andere resultaten op:

Oude PubMed: "breast feed", "breast feeding" etc.

Nieuwe PubMed: ((("breast"[MeSH Terms] OR "breast"[All Fields]) OR "breasts"[All Fields]) OR "breast s"[All Fields]) AND "feed*"[All Fields]

Voor het trunceren van een samengestelde term zijn er nu 3 opties:
- Zet de samengestelde term of frase tussen dubbele aanhalingstekens: "breast feed*"
- Gebruik een veldnaam, bijvoorbeeld titel/abstract: breast feed*[tiab]
- Gebruik een hyphen: breast-feed*

Via de optie ‘Advanced’ kun je zien hoe PubMed heeft gezocht (dat is gelukkig niet veranderd 😊)
Maar vervolgens moet je op ‘Details’ klikken om te zien op welke termen PubMed automatisch heeft gezocht:

Pas je zoekactie eventueel aan door woorden uit je zoekactie te halen als ze niet relevant zijn of door extra MeSH-termen toe te voegen.

Meer informatie:
Bekijk ook eens de PubMed Tutorials
En wil je nog terug naar de oude versie van PubMed dan kan dat hier: https://pmlegacy.ncbi.nlm.nih.gov/

(Met dank aan Frieda Renkens)

Zoeken naar kwalitatief onderzoek (in databanken)

Je kunt grofweg op vier manieren zoeken naar kwalitatief onderzoek (in databanken):

1. Gebruik losse woorden zoals qualitative research, qualitative studie(s), interview, grounded theory, focus group(s) etc. in combinatie met een zoekwoord dat betrekking heeft op je onderwerp.
Combineer de termen met OR (let op de haakjes! en gebruik evt aanhalingstekens rond samengestelde woorden)
Bijv. ("qualitative research" OR "grounded theory") AND vaccination AND communication

2. Gebruik trefwoorden zoals Mesh en Cinahl headings: qualitative research[Mesh], focus groups[Mesh], qualitative studies[Cinahl heading], interviews as topic[Mesh], observational studies as topic[Mesh], phenomenological research[Cinahl heading] etc.
Combineer de termen met OR (let op de haakjes!)
Bijv. ("Interviews as Topic"[Mesh] OR "Qualitative Research"[Mesh]) AND "Vaccination"[Mesh] AND "Communication"[Mesh]
Weet je niet meer hoe je Mesh-termen kunt combineren, bekijk dan de instructiefilmpjes op deze blog

3. Gebruik Publicatietype zoals Interview, personal narrative, anecdote, observational study als filter. Dit kan in PubMed en Cinahl. Maar er zijn maar een paar filters die betrekking hebben op kwalitatief onderzoek. Bovendien zijn dit in feite ook Mesh-termen waarmee je combineert.

4. Gebruik een zoekblok / zoekfilter waarin alle mogelijke zoekwoorden en Mesh-termen zijn opgenomen. Deze zoekblokken worden vaak gemaakt door medisch informatiespecialisten. Plak de termen uit dit zoekblok in PubMed (advanced search builder > gebruik ‘edit’) en combineer deze zoekactie met zoekwoorden die betrekking hebben op je onderwerp.

Voorbeeld Zoekblok van de BMI-KNVI (biomedisch informatiespecialisten van de beroepsorganisatie KNVI - https://blocks.bmi-online.nl/catalog/293):

En daarna combineren met inhoudelijke zoekwoorden (zoals bijv. hier 'vaccination' en 'communication')

N.B. Je kunt in databank CINAHL ook gebruik maken van het filter 'Clinical Queries' (kies: Qualitative). Door dit filter te kiezen combineer je je inhoudelijke zoekterm met een aantal woorden (interview, grounded theory etc.) die te maken hebben met kwalitatief onderzoek.

Databank SpringerLink
Dit is een van de weinige Xplora-databanken waarin niet alleen met Engelse, maar ook met Nederlandse zoektermen gezocht kan worden naar medische / verpleegkundige artikelen en ebooks. SpringerLink bevat ENG/NL ejournals en ebooks van uitgeverij Springer (waaronder ook de NL publicaties van uitgeverij BSL).
Helaas kun je niet zoeken met trefwoorden in SpringerLink, dus je zult veel synoniemen moeten combineren.
SpringerLink is handig om je te oriënteren op een onderwerp en levert soms goede artikelen op, maar moet als bron voor kwalitatief onderzoek zeker aangevuld worden met Cinahl en/of PubMed en/of Cochrane.

Bijv. (kwalitatief OR kwalitatieve) AND (vaccineren OR vaccinatie) > dit levert een aantal artikelen op over kwalitatief onderzoek, maar je moet met ctrl+F goed zoeken waar het woord ‘kwalitatief’ of ‘kwalitatieve’ staat. Je vindt dan bijv. https://link.springer.com.ezproxy.avans.nl/content/pdf/10.1007/s12452-019-00184-5.pdf

Zie evt ook osnfilmpje over zoeken in SpringerLink met Booleaanse operatoren: https://mymedia.avans.nl/media/Zoeken+in+databank+SpringerLink+%28met+AND+en+OR%29/1_gu1eheec

Databank SAGE
Voor ggz/sociale onderwerpen zou ook databank SAGE nog van pas kunnen komen. Gebruik Advanced (zoeken), zet samengestelde termen (zoals bijv. "qualitative research" tussen aanhalingstekens) en filter eventueel op titel of keyword.

Zie ook:
https://guides.lib.uw.edu/hsl/qualres/pubmed
https://guides.lib.unc.edu/qual/find
https://guides.nyu.edu/c.php?g=277034&p=1846828

Hoe vind je goede Engelse zoektermen?

Dat is een van de meest gestelde vragen in de lessen informatievaardigheid en EBP. Hieronder hebben we een paar tips verzameld:

1. Gebruik een woordenboek waarbij je het woord in zijn context ziet, zoals bijvoorbeeld Context Reverso

2. Raadpleeg een medisch woordenboek, of een medische encyclopedie.

Voorbeelden:
- Het medisch woordenboek van Gezondheidsplein bevat ook de vertaling van Nederlandse termen .
- Merck Manual.
- Medische woordenboeken vind je in Xplora. Er is zelfs een verpleegkundig woordenboek verschenen (beschikbaar in Xplora)
- De medische encyclopedie MedlinePlus

3. Bekijk de literatuurverwijzingen van een (Nederlands) artikel of (e)boek. Doorzoek ze op Engelse literatuur en scan de titels op bruikbare Engelse woorden.

4.Zoek op een Nederlandse term in PubMed met [tt] er direct achter. Bijv. ontslaggesprek[tt]. Je zoekt hiermee in samenvattingen van NL artikelen in PubMed. Kijk vervolgens welke Engelstalige woorden in de titel staan of welke (Engelstalige) Mesh-termen bij het artikel horen.

5. Gebruik de trefwoorden (Mesh-termen, Cinahl-headings etc.) in de databanken van Xplora.
Met een trefwoord zoek je op meerdere synoniemen tegelijk. Door bijvoorbeeld op Myocardial infarction[Mesh] te zoeken, vind je ook artikelen waarin gesproken wordt over Heart attack of Cardiovascular stroke(s) of Myocardial infarct(s). Bekijk evt de instructiefilmpjes PubMed en Cinahl.

Zie ook: Hoe vind je goede zoektermen voor je literatuuronderzoek?